56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4614 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  100 
 
 
687 aa  1415    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  72.38 
 
 
686 aa  1040    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  38.51 
 
 
681 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  38.02 
 
 
657 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  37.59 
 
 
657 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  37.68 
 
 
662 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  35.83 
 
 
659 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  36.39 
 
 
663 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  34.92 
 
 
712 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  36.93 
 
 
674 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  37.32 
 
 
655 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  35.75 
 
 
659 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  34.83 
 
 
663 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  35.12 
 
 
660 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  34.19 
 
 
661 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  35.9 
 
 
668 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  35.17 
 
 
659 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  34.93 
 
 
610 aa  350  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  36.57 
 
 
672 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  35.7 
 
 
657 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  34.41 
 
 
661 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  34.92 
 
 
678 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  34.78 
 
 
678 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  35.15 
 
 
675 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  33.62 
 
 
652 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  31 
 
 
672 aa  319  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  35.45 
 
 
692 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  35.48 
 
 
693 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  35.24 
 
 
693 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  31.14 
 
 
672 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  33.33 
 
 
641 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  33.86 
 
 
660 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.14 
 
 
662 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.84 
 
 
659 aa  294  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  29.54 
 
 
651 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  33.52 
 
 
720 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  29.39 
 
 
611 aa  262  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  30.1 
 
 
614 aa  247  6e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  26.07 
 
 
658 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.51 
 
 
651 aa  219  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.61 
 
 
656 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.06 
 
 
565 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.18 
 
 
1433 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  26.65 
 
 
1537 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.74 
 
 
1526 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  25.57 
 
 
1593 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  26 
 
 
725 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.78 
 
 
698 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.31 
 
 
746 aa  49.7  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.32 
 
 
733 aa  48.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.89 
 
 
729 aa  47.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.1 
 
 
732 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.71 
 
 
741 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
194 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.420714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.22 
 
 
757 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.85 
 
 
741 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>