65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08610 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  100 
 
 
661 aa  1366    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  47 
 
 
663 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  45.29 
 
 
668 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  46.68 
 
 
659 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  46.65 
 
 
663 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  44.87 
 
 
655 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  41.77 
 
 
660 aa  510  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  41.69 
 
 
674 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  40.4 
 
 
661 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  42.9 
 
 
657 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  42.9 
 
 
657 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  39.17 
 
 
681 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  42.71 
 
 
662 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  40.31 
 
 
652 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  39.48 
 
 
659 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  39.94 
 
 
659 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  40.45 
 
 
672 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  39.94 
 
 
712 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  38.29 
 
 
675 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  40 
 
 
672 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  38.91 
 
 
610 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  37.82 
 
 
693 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  37.69 
 
 
678 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  37.33 
 
 
693 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  38.9 
 
 
657 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  37.35 
 
 
692 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  37.63 
 
 
678 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  38.12 
 
 
651 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  36.17 
 
 
672 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  35.59 
 
 
686 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  34.59 
 
 
641 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  34.19 
 
 
687 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.98 
 
 
662 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  34.4 
 
 
660 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  34.18 
 
 
720 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.95 
 
 
659 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  33.13 
 
 
614 aa  291  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.21 
 
 
656 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  30.69 
 
 
611 aa  279  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  29.37 
 
 
658 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.06 
 
 
651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.91 
 
 
565 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.94 
 
 
1433 aa  197  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  26.25 
 
 
1593 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.49 
 
 
1537 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.57 
 
 
1526 aa  107  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.59 
 
 
720 aa  71.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.06 
 
 
725 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.3 
 
 
718 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.46 
 
 
723 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.61 
 
 
746 aa  54.3  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.14 
 
 
711 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.55 
 
 
682 aa  50.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.09 
 
 
721 aa  50.4  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.57 
 
 
751 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.37 
 
 
654 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.72 
 
 
726 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.41 
 
 
741 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  21.79 
 
 
751 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.35 
 
 
685 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.68 
 
 
735 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.79 
 
 
751 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.79 
 
 
751 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.75 
 
 
741 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  22.41 
 
 
1044 aa  44.3  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>