102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2343 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 651 aa  1358    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  44.33 
 
 		 672 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  44.04 
 
 		 672 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  39.85 
 
 		 659 aa  482  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  39.33 
 
 		 663 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  35.26 
 
 		 668 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  38.12 
 
 		 661 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  36.16 
 
 		 659 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  37.2 
 
 		 659 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  35.64 
 
 		 663 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  36.71 
 
 		 660 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  37.52 
 
 		 652 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  37.23 
 
 		 661 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  34.35 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  33.28 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  33.73 
 
 		 681 aa  360  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  36.62 
 
 		 662 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  33.28 
 
 		 675 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  33.63 
 
 		 678 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  33.33 
 
 		 678 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  32.39 
 
 		 693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  32.98 
 
 		 693 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  33.23 
 
 		 692 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  44.1 
 
 		 712 aa  336  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  44.16 
 
 		 657 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  44.16 
 
 		 657 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  35.78 
 
 		 610 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  32.25 
 
 		 657 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  30.36 
 
 		 672 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  30.66 
 
 		 641 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  29.54 
 
 		 687 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.13 
 
 		 662 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  30.43 
 
 		 660 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  28.93 
 
 		 686 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  30.28 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  30.22 
 
 		 614 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.38 
 
 		 659 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.49 
 
 		 720 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.48 
 
 		 565 aa  193  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.47 
 
 		 656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  23.75 
 
 		 658 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.42 
 
 		 651 aa  167  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.35 
 
 		 1433 aa  145  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  23.77 
 
 		 1593 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  23.57 
 
 		 1537 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.19 
 
 		 1526 aa  84.3  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.61 
 
 		 725 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.17 
 
 		 721 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.22 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.61 
 
 		 757 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.47 
 
 		 723 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.05 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.28 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.94 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.47 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.12 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.72 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  22.87 
 
 		 723 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  23.82 
 
 		 757 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.42 
 
 		 741 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.28 
 
 		 654 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.65 
 
 		 732 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.2 
 
 		 751 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.6 
 
 		 734 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.59 
 
 		 724 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.84 
 
 		 746 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  21.24 
 
 		 733 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.11 
 
 		 732 aa  51.2  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.42 
 
 		 685 aa  51.2  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.73 
 
 		 685 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.49 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.58 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.05 
 
 		 731 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.25 
 
 		 628 aa  48.5  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.89 
 
 		 751 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.89 
 
 		 751 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.31 
 
 		 760 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.92 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.34 
 
 		 612 aa  47.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  25 
 
 		 751 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  23.08 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.65 
 
 		 732 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.41 
 
 		 735 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.37 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  22.88 
 
 		 729 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.96 
 
 		 708 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  24.79 
 
 		 758 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  23.26 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.34 
 
 		 740 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.12 
 
 		 734 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.34 
 
 		 741 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.34 
 
 		 729 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.46 
 
 		 733 aa  44.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.6 
 
 		 729 aa  44.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.15 
 
 		 741 aa  44.3  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  22.45 
 
 		 770 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.88 
 
 		 735 aa  44.3  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.45 
 
 		 770 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.45 
 
 		 797 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>