122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2675 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  64.89 
 
 		 760 aa  1026    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  66.27 
 
 		 758 aa  1042    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 741 aa  1539    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  65.32 
 
 		 741 aa  996    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.47 
 
 		 725 aa  521  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.83 
 
 		 735 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.36 
 
 		 720 aa  515  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.02 
 
 		 698 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.47 
 
 		 721 aa  505  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.87 
 
 		 764 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.65 
 
 		 732 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.95 
 
 		 781 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.27 
 
 		 765 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.5 
 
 		 708 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.74 
 
 		 735 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  38.08 
 
 		 727 aa  475  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.01 
 
 		 723 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.77 
 
 		 731 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.24 
 
 		 732 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  37.4 
 
 		 733 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.1 
 
 		 778 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.04 
 
 		 778 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.62 
 
 		 729 aa  459  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.4 
 
 		 778 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.51 
 
 		 733 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.62 
 
 		 724 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.69 
 
 		 751 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.48 
 
 		 729 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  35.47 
 
 		 751 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.59 
 
 		 734 aa  439  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.68 
 
 		 734 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.13 
 
 		 711 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.24 
 
 		 751 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.24 
 
 		 751 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.12 
 
 		 717 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.44 
 
 		 741 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.46 
 
 		 757 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  34.78 
 
 		 757 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.27 
 
 		 733 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.43 
 
 		 734 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.62 
 
 		 732 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  35.27 
 
 		 770 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  35.27 
 
 		 758 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.27 
 
 		 776 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.27 
 
 		 770 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.27 
 
 		 797 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.27 
 
 		 776 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.77 
 
 		 733 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.03 
 
 		 723 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.73 
 
 		 736 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.44 
 
 		 716 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.13 
 
 		 736 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.29 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.43 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.43 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.27 
 
 		 746 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.64 
 
 		 720 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.57 
 
 		 740 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.79 
 
 		 759 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.1 
 
 		 741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.97 
 
 		 740 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.47 
 
 		 719 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  35.91 
 
 		 723 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.1 
 
 		 740 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  37.09 
 
 		 712 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.14 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.44 
 
 		 718 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  35.18 
 
 		 675 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  35.82 
 
 		 729 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.36 
 
 		 685 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  35.7 
 
 		 737 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  33.76 
 
 		 706 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  34.86 
 
 		 715 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.27 
 
 		 700 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.05 
 
 		 722 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.3 
 
 		 726 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.68 
 
 		 612 aa  360  6e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.85 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.49 
 
 		 658 aa  352  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.39 
 
 		 776 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.15 
 
 		 623 aa  334  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.84 
 
 		 691 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.84 
 
 		 691 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.75 
 
 		 682 aa  318  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.64 
 
 		 628 aa  310  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  32.08 
 
 		 716 aa  300  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.09 
 
 		 708 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.65 
 
 		 654 aa  275  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.52 
 
 		 689 aa  273  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  31.96 
 
 		 645 aa  268  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.58 
 
 		 834 aa  97.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.89 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.1 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  24.43 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  22.86 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  22.38 
 
 		 681 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  19.73 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  25.95 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  25.95 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.44 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>