119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1034 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.7 
 
 		 734 aa  735    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  75.62 
 
 		 733 aa  1074    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.59 
 
 		 741 aa  759    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  48.55 
 
 		 723 aa  723    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 731 aa  1493    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  80.93 
 
 		 732 aa  1210    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  87.45 
 
 		 732 aa  1318    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  77.58 
 
 		 735 aa  1121    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.64 
 
 		 734 aa  759    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  77.62 
 
 		 733 aa  1154    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.79 
 
 		 734 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.79 
 
 		 733 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.39 
 
 		 778 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  50.27 
 
 		 781 aa  710    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  54.45 
 
 		 764 aa  751    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  62.04 
 
 		 729 aa  914    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.39 
 
 		 778 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.15 
 
 		 732 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.45 
 
 		 736 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.39 
 
 		 729 aa  718    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.25 
 
 		 778 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  54.31 
 
 		 765 aa  747    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.1 
 
 		 736 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46 
 
 		 740 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  46 
 
 		 740 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.86 
 
 		 740 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.54 
 
 		 741 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.86 
 
 		 740 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.02 
 
 		 740 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  46.43 
 
 		 740 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.51 
 
 		 757 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.16 
 
 		 711 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  43.38 
 
 		 757 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  45.48 
 
 		 770 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  45.63 
 
 		 758 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.48 
 
 		 776 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.48 
 
 		 770 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.48 
 
 		 797 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.48 
 
 		 776 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.26 
 
 		 716 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.02 
 
 		 759 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.02 
 
 		 717 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.12 
 
 		 720 aa  547  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  45.19 
 
 		 675 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.42 
 
 		 698 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.85 
 
 		 735 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.2 
 
 		 725 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.92 
 
 		 721 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.77 
 
 		 741 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.52 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  40.8 
 
 		 751 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  37.04 
 
 		 727 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.17 
 
 		 760 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.94 
 
 		 751 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.38 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.8 
 
 		 751 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  36.14 
 
 		 758 aa  452  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.59 
 
 		 751 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.03 
 
 		 708 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.41 
 
 		 724 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.33 
 
 		 723 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.54 
 
 		 746 aa  405  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.4 
 
 		 612 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.14 
 
 		 623 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  36.16 
 
 		 723 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.97 
 
 		 719 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  37.2 
 
 		 715 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.13 
 
 		 700 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  38.23 
 
 		 712 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.01 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  36.76 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  34.03 
 
 		 729 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.8 
 
 		 722 aa  364  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.78 
 
 		 685 aa  361  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  36.11 
 
 		 737 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.75 
 
 		 718 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.26 
 
 		 734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.78 
 
 		 685 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.68 
 
 		 726 aa  353  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.57 
 
 		 658 aa  321  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.66 
 
 		 628 aa  319  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.52 
 
 		 691 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.38 
 
 		 691 aa  297  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  33.66 
 
 		 716 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.74 
 
 		 682 aa  280  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.87 
 
 		 654 aa  279  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.58 
 
 		 776 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  42.68 
 
 		 645 aa  267  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.92 
 
 		 708 aa  247  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.15 
 
 		 689 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.84 
 
 		 868 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.16 
 
 		 834 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.08 
 
 		 676 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.67 
 
 		 676 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  21.61 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.47 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  24.18 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  22.58 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.99 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  23.08 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>