116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4363 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  82.25 
 
 		 675 aa  1131    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  81.88 
 
 		 770 aa  1204    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  94.06 
 
 		 740 aa  1409    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  81.96 
 
 		 758 aa  1188    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  50.65 
 
 		 711 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  69.42 
 
 		 757 aa  1016    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  93.93 
 
 		 740 aa  1408    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 741 aa  1500    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  93.93 
 
 		 740 aa  1408    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.74 
 
 		 776 aa  1202    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.83 
 
 		 770 aa  1200    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.88 
 
 		 797 aa  1204    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.74 
 
 		 776 aa  1202    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  91.09 
 
 		 740 aa  1344    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.02 
 
 		 720 aa  693    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  93.93 
 
 		 740 aa  1407    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  98.79 
 
 		 740 aa  1479    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.35 
 
 		 759 aa  1027    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  69.83 
 
 		 757 aa  1016    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.58 
 
 		 717 aa  699    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  56.01 
 
 		 716 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.22 
 
 		 732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.54 
 
 		 731 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  46.18 
 
 		 733 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.83 
 
 		 732 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.55 
 
 		 735 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.87 
 
 		 741 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.06 
 
 		 733 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.65 
 
 		 723 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.33 
 
 		 734 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.1 
 
 		 732 aa  555  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.9 
 
 		 734 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.99 
 
 		 729 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.21 
 
 		 734 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  46.94 
 
 		 733 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.64 
 
 		 764 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.96 
 
 		 736 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.21 
 
 		 778 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.27 
 
 		 781 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.35 
 
 		 778 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.72 
 
 		 765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.68 
 
 		 736 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.02 
 
 		 778 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.44 
 
 		 729 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.97 
 
 		 735 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.95 
 
 		 751 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.02 
 
 		 751 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.88 
 
 		 751 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  41.1 
 
 		 751 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.71 
 
 		 698 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.26 
 
 		 721 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.7 
 
 		 708 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.93 
 
 		 725 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.33 
 
 		 720 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.59 
 
 		 723 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.1 
 
 		 741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  33.43 
 
 		 727 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.66 
 
 		 760 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  35.16 
 
 		 758 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.5 
 
 		 724 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.58 
 
 		 746 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.17 
 
 		 741 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.7 
 
 		 719 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.78 
 
 		 612 aa  346  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.17 
 
 		 722 aa  345  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.97 
 
 		 623 aa  342  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  34.72 
 
 		 729 aa  340  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.9 
 
 		 685 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.8 
 
 		 685 aa  329  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  35.12 
 
 		 737 aa  327  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.9 
 
 		 700 aa  327  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  33.95 
 
 		 723 aa  326  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  34.58 
 
 		 712 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.49 
 
 		 733 aa  325  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  33.82 
 
 		 715 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.89 
 
 		 734 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  35.39 
 
 		 706 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.48 
 
 		 726 aa  309  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.73 
 
 		 718 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.85 
 
 		 628 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.1 
 
 		 658 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.89 
 
 		 691 aa  273  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.1 
 
 		 691 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.86 
 
 		 682 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  33.68 
 
 		 716 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.9 
 
 		 708 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  33.23 
 
 		 645 aa  247  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.96 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.49 
 
 		 689 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.75 
 
 		 654 aa  220  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.87 
 
 		 868 aa  87.4  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  26.12 
 
 		 834 aa  84.3  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  26.98 
 
 		 668 aa  62  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.71 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.65 
 
 		 659 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  22.54 
 
 		 712 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  25 
 
 		 678 aa  54.3  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  27.3 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  21.97 
 
 		 732 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  25 
 
 		 674 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>