103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1137 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  58.46 
 
 		 645 aa  655    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 682 aa  1335    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.73 
 
 		 689 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  50 
 
 		 716 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  48.48 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  48.75 
 
 		 654 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.61 
 
 		 733 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  38.78 
 
 		 737 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.94 
 
 		 719 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.5 
 
 		 700 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  37.81 
 
 		 715 aa  379  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  37.99 
 
 		 712 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.81 
 
 		 722 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  39.57 
 
 		 706 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.82 
 
 		 698 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.69 
 
 		 718 aa  363  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.41 
 
 		 726 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.94 
 
 		 725 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.76 
 
 		 746 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.76 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.41 
 
 		 735 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.75 
 
 		 741 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  32.98 
 
 		 758 aa  317  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.03 
 
 		 760 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.19 
 
 		 723 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  34.57 
 
 		 723 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  31.76 
 
 		 727 aa  306  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.23 
 
 		 720 aa  305  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  32.4 
 
 		 729 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.54 
 
 		 724 aa  303  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.01 
 
 		 708 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.1 
 
 		 721 aa  296  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.4 
 
 		 685 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.57 
 
 		 612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.79 
 
 		 658 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.49 
 
 		 734 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.74 
 
 		 731 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.72 
 
 		 723 aa  279  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.79 
 
 		 685 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.01 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.41 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.92 
 
 		 623 aa  277  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  43.22 
 
 		 751 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.99 
 
 		 751 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.99 
 
 		 751 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.28 
 
 		 720 aa  270  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.08 
 
 		 716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.82 
 
 		 736 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.45 
 
 		 765 aa  267  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.43 
 
 		 732 aa  266  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.03 
 
 		 764 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.41 
 
 		 751 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.5 
 
 		 740 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.42 
 
 		 732 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.73 
 
 		 781 aa  260  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.41 
 
 		 729 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.71 
 
 		 717 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.86 
 
 		 740 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.7 
 
 		 740 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.7 
 
 		 740 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.36 
 
 		 740 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  40 
 
 		 778 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  38.53 
 
 		 675 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.02 
 
 		 732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.86 
 
 		 741 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.53 
 
 		 776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.53 
 
 		 776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.98 
 
 		 711 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.79 
 
 		 734 aa  254  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.77 
 
 		 778 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.53 
 
 		 797 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  38.53 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.53 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.13 
 
 		 733 aa  253  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.77 
 
 		 778 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  35.91 
 
 		 733 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.94 
 
 		 735 aa  250  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.75 
 
 		 757 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.94 
 
 		 741 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.77 
 
 		 740 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  37.89 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.61 
 
 		 628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.4 
 
 		 729 aa  245  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  31.79 
 
 		 757 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.94 
 
 		 733 aa  243  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.52 
 
 		 759 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.84 
 
 		 736 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.84 
 
 		 691 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.84 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.25 
 
 		 776 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.76 
 
 		 868 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  23.48 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  26.65 
 
 		 834 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  23.32 
 
 		 660 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  25.63 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  25.39 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  25.48 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  27.43 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  25.37 
 
 		 659 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  24.55 
 
 		 661 aa  50.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>