68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2645 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  95.54 
 
 
672 aa  1292    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  100 
 
 
672 aa  1379    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  47.26 
 
 
659 aa  601  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  45 
 
 
663 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  44.33 
 
 
651 aa  534  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  40.27 
 
 
668 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.74 
 
 
663 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  40.42 
 
 
659 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  41.43 
 
 
660 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  40.45 
 
 
661 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  37.27 
 
 
655 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  38.04 
 
 
659 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  37.85 
 
 
661 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  35.33 
 
 
674 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  37.65 
 
 
657 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  36.23 
 
 
678 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  37.99 
 
 
657 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  36.23 
 
 
678 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  37.04 
 
 
610 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  33.53 
 
 
693 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  34.7 
 
 
681 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  37.44 
 
 
662 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  34.49 
 
 
652 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  35.22 
 
 
675 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  32.93 
 
 
693 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  33.23 
 
 
692 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  34.04 
 
 
657 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  33.04 
 
 
672 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  32.67 
 
 
720 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  32.05 
 
 
686 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  31.85 
 
 
641 aa  330  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  43.99 
 
 
712 aa  326  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  30.78 
 
 
660 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.85 
 
 
662 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  31 
 
 
687 aa  319  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.68 
 
 
656 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  31.91 
 
 
614 aa  269  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.31 
 
 
659 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  29.66 
 
 
611 aa  265  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.89 
 
 
651 aa  237  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  27.68 
 
 
658 aa  233  8.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.33 
 
 
565 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.04 
 
 
1433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  25.6 
 
 
1593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.95 
 
 
1526 aa  106  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  26.04 
 
 
1537 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.84 
 
 
725 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  21.2 
 
 
727 aa  71.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.21 
 
 
720 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.32 
 
 
698 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.1 
 
 
741 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.68 
 
 
685 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  22.43 
 
 
758 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.63 
 
 
682 aa  58.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.87 
 
 
741 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.71 
 
 
685 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.22 
 
 
723 aa  55.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.12 
 
 
654 aa  54.3  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.06 
 
 
760 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.72 
 
 
708 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.8 
 
 
721 aa  47.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  20.36 
 
 
706 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.65 
 
 
708 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.93 
 
 
734 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.83 
 
 
628 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.35 
 
 
723 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  20.95 
 
 
959 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  21.58 
 
 
645 aa  43.9  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>