120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4724 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 
760 aa  1584    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  64.89 
 
 
741 aa  1026    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  81.45 
 
 
758 aa  1308    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.01 
 
 
741 aa  1077    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.32 
 
 
720 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.66 
 
 
721 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.24 
 
 
735 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.48 
 
 
725 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.83 
 
 
698 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  38.43 
 
 
733 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.83 
 
 
781 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.31 
 
 
723 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.8 
 
 
732 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.01 
 
 
735 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.17 
 
 
731 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.4 
 
 
732 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.55 
 
 
708 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.56 
 
 
751 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.17 
 
 
734 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  35.99 
 
 
727 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.03 
 
 
764 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.15 
 
 
724 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.03 
 
 
778 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.86 
 
 
765 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.16 
 
 
778 aa  439  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.4 
 
 
778 aa  439  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.34 
 
 
732 aa  439  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  35.45 
 
 
751 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.58 
 
 
751 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.58 
 
 
751 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.56 
 
 
741 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.08 
 
 
723 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.15 
 
 
733 aa  429  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.48 
 
 
729 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.41 
 
 
729 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.99 
 
 
711 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.97 
 
 
736 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.15 
 
 
757 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.96 
 
 
734 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.16 
 
 
717 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.17 
 
 
746 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  34.35 
 
 
757 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.3 
 
 
734 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.12 
 
 
733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.99 
 
 
740 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.79 
 
 
740 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.85 
 
 
740 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.85 
 
 
740 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.6 
 
 
776 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.6 
 
 
776 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.03 
 
 
740 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.65 
 
 
716 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.95 
 
 
736 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  34.6 
 
 
770 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.66 
 
 
741 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.6 
 
 
770 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.6 
 
 
797 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  36.08 
 
 
723 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.33 
 
 
720 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.53 
 
 
740 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  34.6 
 
 
758 aa  399  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.6 
 
 
759 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  34.57 
 
 
675 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  34.69 
 
 
729 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.93 
 
 
733 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.93 
 
 
734 aa  370  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.2 
 
 
685 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.14 
 
 
719 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  34.92 
 
 
737 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  34.63 
 
 
715 aa  363  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.86 
 
 
685 aa  362  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  34.09 
 
 
706 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.73 
 
 
700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.61 
 
 
718 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.63 
 
 
726 aa  348  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  34.73 
 
 
712 aa  346  8.999999999999999e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.35 
 
 
722 aa  343  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.04 
 
 
612 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.96 
 
 
658 aa  340  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.81 
 
 
691 aa  323  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.03 
 
 
682 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.47 
 
 
691 aa  311  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.89 
 
 
776 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.82 
 
 
623 aa  308  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  31.25 
 
 
716 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.07 
 
 
628 aa  283  9e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.21 
 
 
654 aa  280  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.43 
 
 
708 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  42.33 
 
 
645 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.72 
 
 
689 aa  271  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.65 
 
 
868 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  22.99 
 
 
834 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.72 
 
 
676 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.08 
 
 
676 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  24.03 
 
 
852 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  24.18 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  23.37 
 
 
663 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  24.63 
 
 
810 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  24.62 
 
 
657 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  24.62 
 
 
657 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>