108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4932 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  81.51 
 
 		 675 aa  1119    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  81.19 
 
 		 770 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  97.3 
 
 		 740 aa  1466    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  81.54 
 
 		 758 aa  1179    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51.15 
 
 		 711 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  70.52 
 
 		 757 aa  1032    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 740 aa  1498    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  93.93 
 
 		 741 aa  1408    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 740 aa  1498    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.19 
 
 		 776 aa  1190    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.14 
 
 		 770 aa  1187    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.19 
 
 		 797 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.19 
 
 		 776 aa  1190    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  91.62 
 
 		 740 aa  1351    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.67 
 
 		 720 aa  698    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  99.73 
 
 		 740 aa  1494    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  93.66 
 
 		 740 aa  1403    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.14 
 
 		 759 aa  1020    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.52 
 
 		 757 aa  1030    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  55.09 
 
 		 717 aa  705    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  55.57 
 
 		 716 aa  717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.44 
 
 		 732 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.86 
 
 		 731 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  45.3 
 
 		 733 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.89 
 
 		 732 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.67 
 
 		 735 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.78 
 
 		 733 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  46 
 
 		 741 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.1 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.23 
 
 		 723 aa  552  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.83 
 
 		 734 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.74 
 
 		 734 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.14 
 
 		 729 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.34 
 
 		 734 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  46.93 
 
 		 733 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.95 
 
 		 736 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.6 
 
 		 764 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.05 
 
 		 781 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.04 
 
 		 765 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.52 
 
 		 778 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.66 
 
 		 778 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.83 
 
 		 778 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.41 
 
 		 729 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.94 
 
 		 736 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.52 
 
 		 735 aa  465  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.19 
 
 		 751 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.11 
 
 		 751 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.11 
 
 		 751 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  40.72 
 
 		 751 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.92 
 
 		 698 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.31 
 
 		 708 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.26 
 
 		 721 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.73 
 
 		 725 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.33 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.58 
 
 		 723 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.43 
 
 		 741 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.85 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  35.06 
 
 		 758 aa  403  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.78 
 
 		 741 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.25 
 
 		 746 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.62 
 
 		 724 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  32.81 
 
 		 727 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.04 
 
 		 719 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.95 
 
 		 612 aa  353  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.64 
 
 		 722 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  33.98 
 
 		 712 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  34.43 
 
 		 729 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.74 
 
 		 623 aa  339  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.83 
 
 		 700 aa  334  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  34.73 
 
 		 715 aa  333  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  34.59 
 
 		 737 aa  330  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.05 
 
 		 685 aa  329  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.6 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.26 
 
 		 685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  34.15 
 
 		 723 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.37 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.9 
 
 		 726 aa  316  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.51 
 
 		 718 aa  312  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  34.79 
 
 		 706 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.41 
 
 		 658 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.74 
 
 		 628 aa  297  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.88 
 
 		 691 aa  277  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.88 
 
 		 691 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.7 
 
 		 682 aa  258  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.08 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  34.18 
 
 		 716 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.85 
 
 		 708 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  32.41 
 
 		 645 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.86 
 
 		 689 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.98 
 
 		 654 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.38 
 
 		 868 aa  89.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.27 
 
 		 834 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  27.21 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.71 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  28.08 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  22.31 
 
 		 712 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.25 
 
 		 732 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.55 
 
 		 565 aa  53.9  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  25.06 
 
 		 678 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  24.88 
 
 		 678 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>