96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 645 aa  1258    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  58.69 
 
 		 682 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  58.16 
 
 		 689 aa  633  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  52.35 
 
 		 654 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  53.61 
 
 		 716 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  49.38 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.54 
 
 		 719 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.39 
 
 		 733 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  38.41 
 
 		 715 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.68 
 
 		 700 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.29 
 
 		 722 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.55 
 
 		 718 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  39.17 
 
 		 712 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  38.12 
 
 		 737 aa  347  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  39.84 
 
 		 706 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  48.73 
 
 		 746 aa  336  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.28 
 
 		 698 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.72 
 
 		 726 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.4 
 
 		 721 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.44 
 
 		 725 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.09 
 
 		 735 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.04 
 
 		 720 aa  300  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.02 
 
 		 623 aa  296  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.96 
 
 		 723 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.91 
 
 		 741 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  33.69 
 
 		 729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.9 
 
 		 612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.86 
 
 		 734 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.06 
 
 		 778 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.82 
 
 		 778 aa  280  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  32.45 
 
 		 727 aa  280  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.63 
 
 		 685 aa  280  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.56 
 
 		 778 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  40.98 
 
 		 758 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.29 
 
 		 724 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.97 
 
 		 781 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.65 
 
 		 760 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  34.38 
 
 		 723 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.6 
 
 		 723 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.93 
 
 		 731 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.2 
 
 		 734 aa  272  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.1 
 
 		 685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.75 
 
 		 741 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.66 
 
 		 741 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.05 
 
 		 658 aa  266  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.1 
 
 		 732 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.28 
 
 		 708 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.24 
 
 		 765 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.05 
 
 		 733 aa  264  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.14 
 
 		 735 aa  264  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.24 
 
 		 734 aa  264  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.2 
 
 		 764 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.58 
 
 		 736 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.73 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.86 
 
 		 717 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.81 
 
 		 628 aa  260  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.45 
 
 		 729 aa  260  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.45 
 
 		 736 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  43.99 
 
 		 751 aa  257  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.55 
 
 		 729 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.6 
 
 		 716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.75 
 
 		 751 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  40.98 
 
 		 733 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.75 
 
 		 751 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.18 
 
 		 741 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.13 
 
 		 711 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.87 
 
 		 734 aa  250  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.23 
 
 		 740 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.43 
 
 		 751 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.56 
 
 		 733 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.91 
 
 		 740 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.06 
 
 		 732 aa  244  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.38 
 
 		 740 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.22 
 
 		 740 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.22 
 
 		 740 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.85 
 
 		 740 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.37 
 
 		 757 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  32.66 
 
 		 758 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.19 
 
 		 720 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.98 
 
 		 759 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  31.91 
 
 		 757 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  39.09 
 
 		 770 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.09 
 
 		 797 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.09 
 
 		 770 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  39.09 
 
 		 675 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.09 
 
 		 776 aa  230  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.09 
 
 		 776 aa  230  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.43 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.88 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.06 
 
 		 776 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.9 
 
 		 834 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.53 
 
 		 868 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  24.75 
 
 		 661 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  21.65 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.91 
 
 		 565 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  20.13 
 
 		 651 aa  44.3  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>