111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0692 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 734 aa  1496    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  56.67 
 
 		 733 aa  735    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  66.11 
 
 		 741 aa  945    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  50.56 
 
 		 723 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.2 
 
 		 731 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  55.43 
 
 		 732 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.41 
 
 		 732 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  56.81 
 
 		 735 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  65.08 
 
 		 734 aa  914    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  54.66 
 
 		 733 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  64.5 
 
 		 734 aa  919    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  64.36 
 
 		 733 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  50.95 
 
 		 778 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  50.13 
 
 		 781 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.67 
 
 		 764 aa  736    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.2 
 
 		 729 aa  740    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  50.81 
 
 		 778 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  58.37 
 
 		 732 aa  785    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  65.68 
 
 		 736 aa  935    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.94 
 
 		 729 aa  748    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.01 
 
 		 778 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.87 
 
 		 765 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  65.24 
 
 		 736 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.02 
 
 		 717 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  47.81 
 
 		 716 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.4 
 
 		 740 aa  572  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.54 
 
 		 740 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.9 
 
 		 741 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.6 
 
 		 757 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.88 
 
 		 740 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.76 
 
 		 740 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  44.82 
 
 		 758 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.74 
 
 		 740 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.74 
 
 		 740 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  42.02 
 
 		 757 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  44.68 
 
 		 770 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.68 
 
 		 776 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.54 
 
 		 770 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.68 
 
 		 797 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.68 
 
 		 776 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.26 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.37 
 
 		 759 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.8 
 
 		 711 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  45.17 
 
 		 675 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.59 
 
 		 720 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.46 
 
 		 698 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.34 
 
 		 735 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.78 
 
 		 725 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.98 
 
 		 721 aa  485  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.5 
 
 		 751 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  40.36 
 
 		 751 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.39 
 
 		 751 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.39 
 
 		 751 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.17 
 
 		 760 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  38.12 
 
 		 758 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.97 
 
 		 741 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.7 
 
 		 723 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.82 
 
 		 741 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.61 
 
 		 724 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.56 
 
 		 746 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  34.52 
 
 		 727 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.5 
 
 		 708 aa  429  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.69 
 
 		 623 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.86 
 
 		 612 aa  412  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.09 
 
 		 733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.23 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  39.01 
 
 		 715 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  37.04 
 
 		 729 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.22 
 
 		 719 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.43 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  36.79 
 
 		 723 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  37.9 
 
 		 712 aa  376  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  38.15 
 
 		 737 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.51 
 
 		 685 aa  364  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.13 
 
 		 718 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.4 
 
 		 685 aa  360  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  37.66 
 
 		 706 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.37 
 
 		 734 aa  358  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.54 
 
 		 726 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.38 
 
 		 628 aa  346  8.999999999999999e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.97 
 
 		 658 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.9 
 
 		 691 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.97 
 
 		 691 aa  306  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.47 
 
 		 682 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  43.63 
 
 		 645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  33.53 
 
 		 716 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.98 
 
 		 654 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.11 
 
 		 776 aa  257  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.43 
 
 		 708 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.2 
 
 		 689 aa  220  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.31 
 
 		 868 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  24.66 
 
 		 834 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.3 
 
 		 676 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.53 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  21.66 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  32.92 
 
 		 423 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  20.63 
 
 		 651 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  22.16 
 
 		 810 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  25.91 
 
 		 926 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  20.6 
 
 		 581 aa  54.3  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>