172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2027 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  55.88 
 
 		 708 aa  769    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 		 732 aa  1481    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  44.29 
 
 		 852 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  43.26 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  43.62 
 
 		 717 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 721 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 		 718 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  35.79 
 
 		 783 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  35.79 
 
 		 783 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  35.79 
 
 		 783 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  35.92 
 
 		 783 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  35.79 
 
 		 783 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  35.79 
 
 		 783 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  35.27 
 
 		 783 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  35.79 
 
 		 783 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  34.41 
 
 		 790 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  33.59 
 
 		 896 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  33.27 
 
 		 896 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 581 aa  146  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  27.54 
 
 		 452 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  30.55 
 
 		 543 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  25.41 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  26.05 
 
 		 441 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  29.86 
 
 		 745 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  26.44 
 
 		 478 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  26.6 
 
 		 423 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  26.11 
 
 		 445 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.49 
 
 		 566 aa  97.8  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  23.56 
 
 		 433 aa  92  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  27.14 
 
 		 476 aa  91.3  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.65 
 
 		 734 aa  90.9  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  25.45 
 
 		 575 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  24.11 
 
 		 431 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.74 
 
 		 736 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.42 
 
 		 736 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  25.25 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  23.63 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.05 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  24.34 
 
 		 459 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.34 
 
 		 764 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.86 
 
 		 914 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  27.95 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.99 
 
 		 734 aa  74.7  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.71 
 
 		 733 aa  73.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.92 
 
 		 741 aa  73.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  24.19 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.68 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.08 
 
 		 681 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  23.9 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  23.19 
 
 		 432 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  22.6 
 
 		 514 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  22.6 
 
 		 514 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.42 
 
 		 781 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  23.06 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  23.97 
 
 		 913 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  23.97 
 
 		 914 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.62 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  21.72 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  21.99 
 
 		 896 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.05 
 
 		 732 aa  64.3  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  21.19 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.21 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  23.89 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  24.58 
 
 		 913 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  21.85 
 
 		 675 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  21.85 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  21.85 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.95 
 
 		 711 aa  60.1  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  24.09 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.51 
 
 		 732 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  25 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.85 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.85 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  23.91 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.85 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.85 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  23.08 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  22.98 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  23.83 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  23.18 
 
 		 890 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  26.79 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  34.27 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.51 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.32 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  23.44 
 
 		 886 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.15 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.55 
 
 		 740 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  22.9 
 
 		 883 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.54 
 
 		 733 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  21.74 
 
 		 903 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.54 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  24.45 
 
 		 933 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  23.78 
 
 		 935 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  19.74 
 
 		 833 aa  56.6  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  26.61 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  21.93 
 
 		 419 aa  55.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>