137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0503 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 		 452 aa  926    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  61.36 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  47.11 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  42.92 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  42.07 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  37.76 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  35.21 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  42.57 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  41.57 
 
 		 440 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  40.63 
 
 		 446 aa  276  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  41.37 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  37.14 
 
 		 478 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  40.77 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  40.45 
 
 		 459 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  39.77 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  39.77 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  39.77 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  38.37 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  37 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  38.88 
 
 		 452 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  36.18 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  37.91 
 
 		 441 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  36.24 
 
 		 419 aa  240  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  36.15 
 
 		 424 aa  230  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  27.54 
 
 		 732 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 581 aa  139  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  29.69 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  26.21 
 
 		 717 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  25.59 
 
 		 708 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  28.44 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 738 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 721 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 718 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.35 
 
 		 852 aa  96.7  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  25.92 
 
 		 543 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  23.61 
 
 		 783 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  23.41 
 
 		 783 aa  87  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  23.37 
 
 		 783 aa  87  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  23.17 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  23.17 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  23.41 
 
 		 783 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  23.42 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  22.79 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  21.86 
 
 		 790 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  28.88 
 
 		 896 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  29.6 
 
 		 745 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  28.71 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.32 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  29.17 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  28.7 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  32.91 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  32.44 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  26.67 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  23.66 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  23.66 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  30.41 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  27.36 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  22.92 
 
 		 896 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  26.67 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  28.44 
 
 		 621 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  28.11 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  28.96 
 
 		 574 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.33 
 
 		 717 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  25.18 
 
 		 535 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  28.99 
 
 		 706 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  27.23 
 
 		 607 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  25.74 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  27.23 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  27.72 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  30.53 
 
 		 737 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  26.39 
 
 		 588 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  27.23 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  27.72 
 
 		 623 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  27.72 
 
 		 565 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  30.99 
 
 		 557 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  25.47 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  25.47 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  25.47 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  27.72 
 
 		 562 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  30.08 
 
 		 811 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  24.69 
 
 		 536 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  21.88 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  25.68 
 
 		 733 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  22.9 
 
 		 886 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  26.83 
 
 		 751 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  25 
 
 		 549 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  25 
 
 		 549 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  26.11 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  31.33 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  21.63 
 
 		 681 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  27.14 
 
 		 572 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>