42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1970 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  73.16 
 
 		 783 aa  1220    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  48.33 
 
 		 896 aa  791    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  73.04 
 
 		 783 aa  1219    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  72.53 
 
 		 783 aa  1217    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  73.42 
 
 		 783 aa  1223    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  73.04 
 
 		 783 aa  1219    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 790 aa  1647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  73.29 
 
 		 783 aa  1221    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  73.04 
 
 		 783 aa  1218    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  46.44 
 
 		 896 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  73.04 
 
 		 783 aa  1219    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  38.7 
 
 		 852 aa  532  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  37.35 
 
 		 717 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  35.46 
 
 		 732 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  36.18 
 
 		 738 aa  438  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 718 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 721 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  35.12 
 
 		 708 aa  416  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 581 aa  99.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  21.86 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  30.21 
 
 		 745 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  23.26 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  28.14 
 
 		 476 aa  70.5  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  22.44 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  32 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  24.39 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.64 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  29.75 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  22.99 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  22.05 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.86 
 
 		 566 aa  57.4  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 681 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  19.42 
 
 		 433 aa  55.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  26.34 
 
 		 474 aa  53.9  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  21.99 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  22.48 
 
 		 509 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.46 
 
 		 734 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  20.93 
 
 		 456 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  22.22 
 
 		 896 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  25.11 
 
 		 401 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  27.46 
 
 		 516 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.76 
 
 		 759 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>