124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2376 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  897    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  61.36 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  47.56 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  41.28 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  37.97 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  41.71 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  35.62 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  34.65 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  38.76 
 
 		 478 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  36.64 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  36.16 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  38.24 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  36.24 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  37.27 
 
 		 445 aa  242  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  36.7 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  36.14 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  36.24 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  34.32 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  34.32 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  34.32 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  35.7 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  34.1 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  34.2 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  33.1 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 581 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  26.05 
 
 		 732 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 718 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 738 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  27.42 
 
 		 717 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  26.68 
 
 		 708 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 721 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  27.04 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  23.71 
 
 		 852 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  23.01 
 
 		 783 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  22.96 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  22.74 
 
 		 783 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  22.72 
 
 		 783 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  22.67 
 
 		 783 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  22.74 
 
 		 783 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  33 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  23.23 
 
 		 783 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  22.54 
 
 		 783 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 896 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  22.22 
 
 		 790 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  25.5 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  26.94 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  29.87 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  30 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  29.72 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  24.53 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  24.53 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  28.87 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  26.09 
 
 		 749 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  26 
 
 		 745 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  19.85 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.61 
 
 		 736 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  28.83 
 
 		 588 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  26.34 
 
 		 896 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  29.03 
 
 		 544 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  24.68 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.15 
 
 		 736 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  25.69 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  23.85 
 
 		 733 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  24.83 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  24.83 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  26.79 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  27.65 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  24.83 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  24.83 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  24.83 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  24.83 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  32.06 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  26.61 
 
 		 568 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  20.93 
 
 		 833 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  24.83 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.27 
 
 		 781 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  24.18 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  24.18 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.1 
 
 		 716 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  24.84 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  27.59 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  22.88 
 
 		 549 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  29.93 
 
 		 712 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.17 
 
 		 734 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  33.9 
 
 		 751 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  28.78 
 
 		 681 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  30 
 
 		 572 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>