36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1356 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  858    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  52.43 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  45.91 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  40.86 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  41.52 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  36.99 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  34.66 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  36.15 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  36.1 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  34.73 
 
 		 468 aa  216  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  34.2 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  33.26 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  34.79 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  33.71 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  33.71 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  31.42 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  31.42 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  31.42 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  31.42 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  33.11 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  32.24 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  32.1 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  32.55 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  33.18 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.9 
 
 		 852 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  25.55 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  22.14 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  28 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.98 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.07 
 
 		 718 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  22.03 
 
 		 721 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  35.29 
 
 		 566 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.4 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 738 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>