36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0169 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  874    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  53.86 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  53.93 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  53.93 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  53.21 
 
 		 446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  53.21 
 
 		 446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  53.21 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  55.32 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  55.71 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  52.95 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  50.56 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  38.37 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  38.05 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  34.91 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  36.3 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  34.49 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  35.4 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  34.17 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  34.09 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  32.27 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  35.24 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  34.62 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  33.71 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  35.28 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.34 
 
 		 717 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  24.24 
 
 		 708 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.32 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  25.23 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 721 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  23.41 
 
 		 738 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.78 
 
 		 852 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  35.62 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  33.72 
 
 		 732 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  29.55 
 
 		 575 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>