98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7692 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  100 
 
 		 543 aa  1063    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  28.99 
 
 		 708 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  30.62 
 
 		 732 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  27.36 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 581 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  29.36 
 
 		 717 aa  143  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  26.51 
 
 		 852 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 738 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 718 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 		 721 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  26.61 
 
 		 575 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  29.21 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  28.57 
 
 		 440 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  27.71 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  26.15 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  39.5 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  32.32 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  27.05 
 
 		 745 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  22.79 
 
 		 433 aa  88.6  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  34.94 
 
 		 444 aa  87.8  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  26.35 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  25.75 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  33 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  30.95 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  28.25 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  23.05 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  28.5 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  29.13 
 
 		 783 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  29.13 
 
 		 783 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  28.71 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  29.13 
 
 		 783 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  35.48 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  28.22 
 
 		 783 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  28.71 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  28.36 
 
 		 783 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  24 
 
 		 912 aa  65.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  39.71 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  26.42 
 
 		 896 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  27.65 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  27.32 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  23.16 
 
 		 881 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  30.99 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  26.58 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.03 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.52 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  26.05 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  29.17 
 
 		 452 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  30.36 
 
 		 446 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  30.36 
 
 		 450 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  30.36 
 
 		 446 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.87 
 
 		 720 aa  57  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  21.92 
 
 		 914 aa  57  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  22.92 
 
 		 833 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.33 
 
 		 720 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  29.38 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  20.72 
 
 		 886 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  27.83 
 
 		 729 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  23.79 
 
 		 901 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  29.17 
 
 		 441 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.99 
 
 		 725 aa  55.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.13 
 
 		 612 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.51 
 
 		 628 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  28.1 
 
 		 716 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  25.45 
 
 		 476 aa  54.3  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  24.9 
 
 		 749 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.35 
 
 		 623 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.58 
 
 		 733 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.61 
 
 		 723 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.1 
 
 		 708 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  28.24 
 
 		 419 aa  50.4  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  24.24 
 
 		 890 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.78 
 
 		 781 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  21.24 
 
 		 911 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.87 
 
 		 698 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  27.62 
 
 		 715 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  24.1 
 
 		 887 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  23.57 
 
 		 896 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  25.14 
 
 		 883 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  23.11 
 
 		 892 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.97 
 
 		 759 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  22.79 
 
 		 903 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  22.3 
 
 		 913 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  28.02 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  22.58 
 
 		 1047 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  35.71 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  22.27 
 
 		 895 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  23.66 
 
 		 890 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.6 
 
 		 732 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.58 
 
 		 729 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.17 
 
 		 731 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  23.5 
 
 		 733 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  23.11 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.31 
 
 		 734 aa  44.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  20.38 
 
 		 1144 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  23.08 
 
 		 896 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.67 
 
 		 727 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3337  hypothetical protein  28.28 
 
 		 737 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>