47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3385 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  47.97 
 
 
891 aa  816    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522879 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  46.91 
 
 
1036 aa  818    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  60.38 
 
 
911 aa  1037    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  60.82 
 
 
914 aa  1073    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  60.14 
 
 
913 aa  1047    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  60.54 
 
 
935 aa  1063    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  49.27 
 
 
915 aa  899    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  53.31 
 
 
917 aa  911    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  51.51 
 
 
913 aa  916    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  54.26 
 
 
901 aa  990    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  52.54 
 
 
896 aa  973    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  49.22 
 
 
895 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  57.53 
 
 
881 aa  960    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  48.2 
 
 
887 aa  822    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  54.22 
 
 
869 aa  967    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  49.27 
 
 
915 aa  898    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  45.32 
 
 
912 aa  706    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  49.71 
 
 
893 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  49.55 
 
 
896 aa  841    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  51.93 
 
 
892 aa  957    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  56.43 
 
 
903 aa  979    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  52.45 
 
 
885 aa  908    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  49.1 
 
 
911 aa  780    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  50.34 
 
 
891 aa  946    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  53.58 
 
 
886 aa  967    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  47.91 
 
 
897 aa  795    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  49.54 
 
 
890 aa  865    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  47.46 
 
 
901 aa  786    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  61 
 
 
933 aa  1064    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  49.27 
 
 
912 aa  879    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  52.34 
 
 
881 aa  996    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  49.08 
 
 
883 aa  917    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  51.58 
 
 
910 aa  880    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  51.78 
 
 
919 aa  916    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  44.71 
 
 
1047 aa  802    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  100 
 
 
890 aa  1806    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  51.29 
 
 
921 aa  887    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  50.5 
 
 
901 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  55.61 
 
 
905 aa  936    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  47.73 
 
 
1144 aa  579  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.18 
 
 
732 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
721 aa  58.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  23.11 
 
 
708 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  22.73 
 
 
749 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  20.53 
 
 
833 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.34 
 
 
852 aa  47  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.61 
 
 
717 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>