42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5810 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  48.39 
 
 
887 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  49.32 
 
 
1036 aa  857    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  57.85 
 
 
935 aa  971    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  49.32 
 
 
915 aa  870    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  51.68 
 
 
917 aa  847    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  51.46 
 
 
913 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  53.34 
 
 
901 aa  949    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  54.15 
 
 
896 aa  1023    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  51.18 
 
 
895 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  48.81 
 
 
891 aa  822    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  57.36 
 
 
913 aa  961    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  55.06 
 
 
869 aa  969    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  49.43 
 
 
915 aa  870    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  46.38 
 
 
912 aa  740    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  49.38 
 
 
893 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  49.89 
 
 
896 aa  835    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  55.15 
 
 
892 aa  1002    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  55.48 
 
 
903 aa  993    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  52.45 
 
 
885 aa  930    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  50.83 
 
 
911 aa  840    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  52.34 
 
 
891 aa  935    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  53.5 
 
 
1144 aa  638    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  53.43 
 
 
886 aa  946    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  48.43 
 
 
897 aa  806    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  48.46 
 
 
890 aa  823    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  47.97 
 
 
901 aa  792    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  58.48 
 
 
933 aa  977    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  48.52 
 
 
912 aa  851    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  54.23 
 
 
881 aa  1026    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  50.91 
 
 
883 aa  964    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  56.42 
 
 
914 aa  965    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  51.62 
 
 
910 aa  873    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  50.39 
 
 
919 aa  895    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  50.69 
 
 
1047 aa  883    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  50.28 
 
 
921 aa  862    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  52.4 
 
 
901 aa  832    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  82.13 
 
 
905 aa  1436    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  57.53 
 
 
890 aa  960    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  100 
 
 
881 aa  1778    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  58.05 
 
 
911 aa  964    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  21.82 
 
 
732 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  21.94 
 
 
708 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>