47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3230 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522879 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  44.22 
 
 		 1036 aa  776    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  48.72 
 
 		 914 aa  864    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  49.55 
 
 		 913 aa  851    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  49.55 
 
 		 935 aa  838    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  51.02 
 
 		 915 aa  872    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  51.55 
 
 		 917 aa  863    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  48.71 
 
 		 913 aa  848    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  49.94 
 
 		 901 aa  904    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  47.7 
 
 		 896 aa  870    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  50 
 
 		 895 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  49.89 
 
 		 911 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  66.36 
 
 		 887 aa  1203    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  48.75 
 
 		 869 aa  864    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  51.25 
 
 		 915 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  46.14 
 
 		 912 aa  743    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  54 
 
 		 893 aa  971    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  48.84 
 
 		 896 aa  834    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  47.11 
 
 		 892 aa  841    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  51.54 
 
 		 903 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  49.6 
 
 		 885 aa  881    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  46.85 
 
 		 911 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  47.97 
 
 		 890 aa  831    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  51.87 
 
 		 886 aa  919    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  45.96 
 
 		 897 aa  778    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  48.3 
 
 		 890 aa  818    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  45.69 
 
 		 901 aa  769    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  50.11 
 
 		 933 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  49.26 
 
 		 912 aa  861    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  47.9 
 
 		 881 aa  859    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  48.14 
 
 		 883 aa  867    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  48.47 
 
 		 891 aa  876    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  49.61 
 
 		 910 aa  852    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  51.24 
 
 		 919 aa  877    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  45.7 
 
 		 1047 aa  803    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  50.11 
 
 		 921 aa  866    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  49.21 
 
 		 901 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  49.49 
 
 		 905 aa  841    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  48.81 
 
 		 881 aa  834    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  47.89 
 
 		 1144 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  24.91 
 
 		 708 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 721 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  23.24 
 
 		 852 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  24.63 
 
 		 543 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  21.15 
 
 		 732 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 718 aa  47.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.69 
 
 		 717 aa  45.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>