43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4080 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  48.89 
 
 
887 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  49.29 
 
 
914 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  49.04 
 
 
913 aa  872    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  51.08 
 
 
935 aa  884    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  62.75 
 
 
915 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  62.76 
 
 
917 aa  1163    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  59.91 
 
 
913 aa  1097    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  57.63 
 
 
901 aa  1058    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  50.45 
 
 
896 aa  926    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  47.69 
 
 
895 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  49.26 
 
 
891 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  50.79 
 
 
911 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  51.61 
 
 
869 aa  924    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  62.93 
 
 
915 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  43.4 
 
 
912 aa  730    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  49.15 
 
 
893 aa  862    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  50.06 
 
 
896 aa  874    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  53.47 
 
 
892 aa  952    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  53.28 
 
 
903 aa  965    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  53.83 
 
 
885 aa  972    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  46.96 
 
 
911 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  48.52 
 
 
881 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  58.52 
 
 
886 aa  1081    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  47.72 
 
 
897 aa  830    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  51.37 
 
 
890 aa  922    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  46.31 
 
 
901 aa  795    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  50.91 
 
 
933 aa  875    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  100 
 
 
912 aa  1899    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  53.51 
 
 
881 aa  957    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  51.47 
 
 
883 aa  943    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  55.62 
 
 
891 aa  1040    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  62.91 
 
 
910 aa  1167    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  62.02 
 
 
919 aa  1147    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  49.73 
 
 
1047 aa  892    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  63.04 
 
 
921 aa  1171    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  48.08 
 
 
901 aa  802    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  49.26 
 
 
905 aa  860    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  49.27 
 
 
890 aa  879    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0706228 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  50.67 
 
 
1036 aa  887    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  52.71 
 
 
1144 aa  632  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  24.51 
 
 
749 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 
721 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.76 
 
 
732 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>