48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4938 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  47.7 
 
 		 891 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  54.15 
 
 		 881 aa  1023    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  49.16 
 
 		 1036 aa  890    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  53.07 
 
 		 914 aa  968    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  51.98 
 
 		 913 aa  940    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  53.89 
 
 		 935 aa  961    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  51.77 
 
 		 915 aa  953    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  52.4 
 
 		 917 aa  912    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  52.87 
 
 		 913 aa  962    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  55.19 
 
 		 901 aa  1033    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  100 
 
 		 896 aa  1867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  45.57 
 
 		 895 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  53.39 
 
 		 911 aa  957    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  46.31 
 
 		 887 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  56.61 
 
 		 869 aa  1030    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  51.21 
 
 		 915 aa  952    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  41.27 
 
 		 912 aa  710    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  49.22 
 
 		 893 aa  867    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  49.28 
 
 		 896 aa  901    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  68.27 
 
 		 892 aa  1290    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  56.65 
 
 		 903 aa  1040    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  52.05 
 
 		 885 aa  934    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  45.51 
 
 		 911 aa  800    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  56.12 
 
 		 891 aa  1027    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  52.25 
 
 		 1144 aa  657    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  56.72 
 
 		 886 aa  1044    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  45.74 
 
 		 897 aa  797    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  47.51 
 
 		 890 aa  870    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  44.84 
 
 		 901 aa  783    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  53.99 
 
 		 933 aa  953    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  50.45 
 
 		 912 aa  926    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  62.91 
 
 		 881 aa  1187    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  55.82 
 
 		 883 aa  1073    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  52.54 
 
 		 890 aa  973    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  52.47 
 
 		 910 aa  935    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  51.26 
 
 		 919 aa  957    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  49.49 
 
 		 1047 aa  902    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  50.96 
 
 		 921 aa  917    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  45.78 
 
 		 901 aa  786    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  53.57 
 
 		 905 aa  986    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  23.97 
 
 		 708 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.83 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  24.14 
 
 		 852 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  20.91 
 
 		 721 aa  54.3  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  20.96 
 
 		 717 aa  52.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 718 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 581 aa  48.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  23.08 
 
 		 543 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>