139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3625 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 		 717 aa  1468    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  57.47 
 
 		 738 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  55.79 
 
 		 718 aa  785    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  56.41 
 
 		 721 aa  799    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  41.95 
 
 		 852 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  43.62 
 
 		 732 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  44.46 
 
 		 708 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  37.35 
 
 		 790 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  37.06 
 
 		 783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  37.06 
 
 		 783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  37.06 
 
 		 783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  37.06 
 
 		 783 aa  445  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  36.93 
 
 		 783 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  37.06 
 
 		 783 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  36.93 
 
 		 783 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  36.79 
 
 		 783 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  32.97 
 
 		 896 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  30.88 
 
 		 896 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 581 aa  146  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.67 
 
 		 543 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  27.59 
 
 		 444 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  27.42 
 
 		 441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  26.21 
 
 		 452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  28.72 
 
 		 745 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  26.13 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  27.07 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  25.86 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  23.17 
 
 		 566 aa  97.4  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  23.04 
 
 		 431 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  28.72 
 
 		 476 aa  93.2  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  21.62 
 
 		 433 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  25.8 
 
 		 575 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  25.5 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  25.7 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  26.59 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  24.94 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  28.48 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.25 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  26.09 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  23.85 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  24.66 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  24.66 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  24.66 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  25.06 
 
 		 468 aa  72  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  25.09 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  26.26 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  25.34 
 
 		 439 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  29.65 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.2 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  25.64 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  25.11 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  24.16 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.59 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  23.98 
 
 		 514 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  23.98 
 
 		 514 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  25.18 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  23.64 
 
 		 509 aa  62  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.37 
 
 		 700 aa  62  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  24.5 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.03 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  22.14 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.68 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  22.68 
 
 		 737 aa  61.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.47 
 
 		 914 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  31.17 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  25.26 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  24.33 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  20.39 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.71 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.8 
 
 		 716 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  21.96 
 
 		 715 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  24.83 
 
 		 915 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.2 
 
 		 717 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  23.95 
 
 		 729 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  23.45 
 
 		 452 aa  55.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  24.83 
 
 		 915 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  25.49 
 
 		 544 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.64 
 
 		 781 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.41 
 
 		 723 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  32.37 
 
 		 536 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  20.96 
 
 		 896 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  23.49 
 
 		 917 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  26.88 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  22.78 
 
 		 522 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.95 
 
 		 734 aa  51.2  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.03 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 495 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  25.82 
 
 		 913 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22 
 
 		 741 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.23 
 
 		 719 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  22 
 
 		 896 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.64 
 
 		 778 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.2 
 
 		 711 aa  49.3  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.75 
 
 		 733 aa  49.3  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.41 
 
 		 757 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  22.33 
 
 		 892 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.66 
 
 		 724 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.64 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.26 
 
 		 778 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.55 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>