23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39865 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  100 
 
 
833 aa  1722    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  42.52 
 
 
749 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  25.35 
 
 
476 aa  72  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  19.51 
 
 
681 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  19.74 
 
 
732 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  20.89 
 
 
914 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.86 
 
 
852 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  24.09 
 
 
566 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 
1036 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  24.49 
 
 
478 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  25.95 
 
 
445 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  25.68 
 
 
444 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1729  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.27 
 
 
247 aa  50.8  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.2392  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  20.53 
 
 
890 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  22.4 
 
 
891 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  22.03 
 
 
441 aa  47.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  22.33 
 
 
708 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 
1047 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  22.15 
 
 
408 aa  46.6  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  24.74 
 
 
452 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  25.93 
 
 
890 aa  46.2  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  19.27 
 
 
738 aa  45.8  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>