93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3506 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  904    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  79.13 
 
 		 478 aa  717    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  36.24 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  37.02 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  37.28 
 
 		 441 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  35.99 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  36.84 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  33.87 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  34.61 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  36.9 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  34.92 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  34.65 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  34.38 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  35.38 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  32.2 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  34.03 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  34.43 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  33.41 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  32.33 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  33.41 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  33.41 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  31.09 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  29.67 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  27.17 
 
 		 708 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  26.83 
 
 		 732 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.79 
 
 		 717 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 721 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 738 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 718 aa  93.2  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  35.84 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  32.54 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.84 
 
 		 852 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  32.8 
 
 		 783 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  32.81 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  32.81 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  32.81 
 
 		 783 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  32.81 
 
 		 783 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  32.81 
 
 		 783 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  32.81 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  32.52 
 
 		 783 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  30.47 
 
 		 914 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  22.05 
 
 		 790 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.46 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  26.75 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  26.06 
 
 		 833 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  26.8 
 
 		 896 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.64 
 
 		 681 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  23.36 
 
 		 749 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  26.02 
 
 		 575 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.44 
 
 		 732 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  25 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  25 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  38.46 
 
 		 723 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  27.85 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  33.68 
 
 		 733 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.18 
 
 		 733 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.18 
 
 		 732 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  40 
 
 		 729 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  27.36 
 
 		 706 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  23.56 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  31.4 
 
 		 737 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.49 
 
 		 751 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.4 
 
 		 718 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.21 
 
 		 736 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.51 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  30 
 
 		 698 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  25.4 
 
 		 896 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  35.62 
 
 		 712 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.38 
 
 		 729 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.88 
 
 		 722 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.55 
 
 		 733 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.92 
 
 		 658 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.88 
 
 		 700 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.77 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  32 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.07 
 
 		 719 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  24.27 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.65 
 
 		 735 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.51 
 
 		 731 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  21.76 
 
 		 509 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.29 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  22.44 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  24.77 
 
 		 529 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.39 
 
 		 736 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  30.1 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.85 
 
 		 685 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.66 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.38 
 
 		 725 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  22.83 
 
 		 476 aa  43.5  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.86 
 
 		 734 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>