46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  941    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  58.37 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  55.53 
 
 		 450 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  56.14 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  55.53 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  55.53 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  54.4 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  54.2 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  52.95 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  50.87 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  48.83 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  39.01 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  37.27 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  40.77 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  36.83 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  35.4 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  36.3 
 
 		 419 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  35.54 
 
 		 441 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  37.7 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  35.03 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  32.41 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  36.22 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  34.73 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  31.01 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  26.44 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  36.11 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.77 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 718 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.43 
 
 		 732 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.57 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  23.47 
 
 		 708 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  30 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  26.79 
 
 		 745 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 		 721 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  26.29 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  26.92 
 
 		 783 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  30.95 
 
 		 852 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  26.92 
 
 		 783 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  26.92 
 
 		 783 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  26.92 
 
 		 783 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  26.92 
 
 		 783 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  26.92 
 
 		 783 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  35.9 
 
 		 783 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  35.9 
 
 		 783 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>