37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3598 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1158    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  31.43 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  26.38 
 
 		 708 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  26.44 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 718 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  25.45 
 
 		 732 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.8 
 
 		 717 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  24.87 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  33.18 
 
 		 424 aa  77  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.98 
 
 		 852 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 738 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  21.67 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  26.63 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  28.5 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  28.7 
 
 		 452 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  24.62 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  24.51 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  35.25 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  23.8 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  22.05 
 
 		 419 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  30.28 
 
 		 478 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  26.29 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  21.67 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  21.67 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  21.67 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  26.52 
 
 		 745 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  21.38 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  21.32 
 
 		 452 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  21.62 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  35.9 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  34.48 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  29.55 
 
 		 439 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  28.22 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  28.22 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>