50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1750 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  928    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  58.37 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  54.59 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  54.16 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  53.71 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  53.71 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  53.54 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  53.93 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  55.71 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  49.89 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  51.28 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  40.45 
 
 		 452 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  37.84 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  40.89 
 
 		 422 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  37.39 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  38.01 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  37.69 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  35.73 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  33.1 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  37.59 
 
 		 440 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  36.32 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  35.81 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  32.65 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  34.77 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  26.35 
 
 		 708 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  26.93 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 718 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  34.76 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.78 
 
 		 732 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 738 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  24.01 
 
 		 717 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.39 
 
 		 852 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  23.59 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  24.83 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  30.53 
 
 		 783 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  30.53 
 
 		 783 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  30.53 
 
 		 783 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  31.3 
 
 		 783 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  31.3 
 
 		 783 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  31.3 
 
 		 783 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  30.53 
 
 		 783 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  28.23 
 
 		 896 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  30.08 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  30.53 
 
 		 783 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  28.76 
 
 		 914 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  25.27 
 
 		 745 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  33.73 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  32.53 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>