41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5389 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  46.49 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  43.1 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  40.19 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  40.77 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  41.52 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  38.72 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  40.42 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  38.05 
 
 		 439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  36.75 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  37 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  37.73 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  35.5 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  36.58 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  35.25 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  35.48 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  35.48 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  35.48 
 
 		 450 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  35.02 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  36.09 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  33.72 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  33.26 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  35.89 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  34.92 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  28.64 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  26.39 
 
 		 708 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  24.94 
 
 		 717 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  24.87 
 
 		 575 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.63 
 
 		 732 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  34.19 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  30.95 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 718 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 		 738 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  28.4 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.2 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  23.36 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  23.02 
 
 		 745 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  24.42 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  25 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>