82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3506 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  100 
 
 		 512 aa  1068    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  50.1 
 
 		 509 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  44.65 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  45.15 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  43.75 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  43.47 
 
 		 535 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  42.15 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  44.42 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  42.15 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  42.15 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  42.36 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  46.62 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  44.42 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  42.15 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  42.15 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  44.42 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  44.63 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  42.36 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  42.36 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  44.42 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  42.36 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  42.15 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  44.42 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  44.21 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  43.12 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  42.77 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  42.77 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  42.77 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  42.77 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  42.77 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  38.66 
 
 		 733 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  42.8 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  40.99 
 
 		 536 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  43.09 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  42.56 
 
 		 570 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  42.47 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  42.89 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  42.68 
 
 		 570 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  38.88 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  42.57 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  41.09 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  41.36 
 
 		 568 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  40.33 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  42.18 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  42.18 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  42.18 
 
 		 607 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  42.09 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  40.45 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  42.18 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  42.18 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  42.09 
 
 		 566 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  39.51 
 
 		 557 aa  362  9e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  40.86 
 
 		 578 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  40.25 
 
 		 572 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  40.25 
 
 		 572 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  40.25 
 
 		 572 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  40.04 
 
 		 557 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  39.92 
 
 		 576 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  39.47 
 
 		 584 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  38.73 
 
 		 574 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  34.52 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  33.97 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  32.87 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  31.11 
 
 		 529 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  32.44 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  27.27 
 
 		 593 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  33.09 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  33.09 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  29.62 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  29.62 
 
 		 621 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  27.65 
 
 		 691 aa  160  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  29.73 
 
 		 751 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  29.82 
 
 		 811 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  29.89 
 
 		 875 aa  150  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5255  neutral trehalase-like protein  44.83 
 
 		 96 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  25 
 
 		 732 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  22.17 
 
 		 444 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  22.68 
 
 		 422 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  19.73 
 
 		 708 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  22.05 
 
 		 452 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.92 
 
 		 717 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>