70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5255 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5255  neutral trehalase-like protein  100 
 
 
96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0179122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  83.82 
 
 
535 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  56.45 
 
 
549 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  60.61 
 
 
607 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  60.61 
 
 
564 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  60.61 
 
 
564 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  57.38 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  57.38 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  57.38 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  61.76 
 
 
557 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  57.38 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  57.38 
 
 
549 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  55.74 
 
 
549 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  55.74 
 
 
549 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  55.74 
 
 
549 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  55.74 
 
 
549 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  56.9 
 
 
535 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  61.19 
 
 
568 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  60.29 
 
 
575 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  46.43 
 
 
733 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  60.29 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  58.93 
 
 
536 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  47.83 
 
 
460 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  55.93 
 
 
588 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  54.24 
 
 
537 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  57.35 
 
 
572 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  58.82 
 
 
574 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  62.3 
 
 
572 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  57.35 
 
 
572 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  57.35 
 
 
578 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  63.93 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  55.77 
 
 
516 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  63.93 
 
 
576 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  54.84 
 
 
549 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  54.84 
 
 
549 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  54.84 
 
 
549 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  61.02 
 
 
545 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  52.05 
 
 
570 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  52.05 
 
 
569 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  52.05 
 
 
570 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  52.05 
 
 
570 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  52.05 
 
 
570 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  44.83 
 
 
512 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  54.1 
 
 
549 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  54.1 
 
 
549 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  58.21 
 
 
551 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  54.24 
 
 
503 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  56.72 
 
 
623 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  56.72 
 
 
565 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  55.88 
 
 
566 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  54.55 
 
 
561 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  52.86 
 
 
557 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.414079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  50.68 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  47.95 
 
 
568 aa  60.1  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  43.94 
 
 
509 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  46.55 
 
 
593 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  55.81 
 
 
691 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  38.46 
 
 
509 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  32.79 
 
 
529 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  38.1 
 
 
514 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  38.1 
 
 
514 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  36.67 
 
 
544 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
495 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  36.51 
 
 
510 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>