85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1934 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  82.97 
 
 		 565 aa  940    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  82.97 
 
 		 565 aa  940    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  99.3 
 
 		 570 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  99.3 
 
 		 570 aa  1168    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  99.3 
 
 		 570 aa  1169    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  98.95 
 
 		 569 aa  1123    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  100 
 
 		 570 aa  1176    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  82.78 
 
 		 565 aa  940    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  82.97 
 
 		 565 aa  940    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  82.97 
 
 		 565 aa  941    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  82.97 
 
 		 565 aa  940    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  76.44 
 
 		 568 aa  893    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  82.97 
 
 		 565 aa  940    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  59.55 
 
 		 561 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  59.6 
 
 		 545 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  59.96 
 
 		 568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  55.77 
 
 		 574 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  58.3 
 
 		 572 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  57.74 
 
 		 584 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  58.3 
 
 		 572 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  58.3 
 
 		 572 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  58.14 
 
 		 557 aa  565  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  57.54 
 
 		 551 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  58.3 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  55.66 
 
 		 575 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  57.09 
 
 		 578 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  52.99 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  56.36 
 
 		 623 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  56.16 
 
 		 607 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  56.16 
 
 		 564 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  56.16 
 
 		 564 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  56.36 
 
 		 565 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  55.65 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  55.92 
 
 		 562 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  51.19 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  51.39 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  51.39 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  51.39 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  51.39 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  51.19 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  51.19 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  51.19 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  51.19 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  51.19 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  51.59 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  51.59 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  51.59 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  51.59 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  51.59 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  52.3 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  49.72 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  51.7 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  47.84 
 
 		 733 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  48.38 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  49.33 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  47.85 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  47.49 
 
 		 503 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  42.6 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  46.3 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  42.68 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  30.91 
 
 		 593 aa  227  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  36.82 
 
 		 529 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  33.98 
 
 		 509 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  34.46 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  34.12 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  34.12 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  31.53 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  27.93 
 
 		 544 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  29.45 
 
 		 691 aa  169  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  30.29 
 
 		 811 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  27.82 
 
 		 621 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  27.57 
 
 		 751 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  27.77 
 
 		 875 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5255  neutral trehalase-like protein  52.05 
 
 		 96 aa  75.5  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  25.6 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.17 
 
 		 914 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  26.54 
 
 		 452 aa  53.9  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  22.16 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  27.09 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.67 
 
 		 732 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  23.19 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  23.19 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  22.99 
 
 		 477 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>