42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5386 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  921    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  74.6 
 
 		 452 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  913    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  91.26 
 
 		 446 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  913    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  90.58 
 
 		 446 aa  833    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  53.54 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  55.53 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  53.21 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  52.94 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  47.43 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  39.77 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  36.18 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  38.34 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  33.86 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  34.32 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  32.95 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  35.48 
 
 		 422 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  35.51 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  33.56 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  35.54 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  34.23 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  31.54 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  31.42 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  27.46 
 
 		 708 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 581 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  34.81 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  24.66 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  30.36 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  24 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.85 
 
 		 732 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  31.82 
 
 		 852 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 		 738 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  21.67 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 		 718 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 721 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  26.43 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  23.08 
 
 		 745 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  26.98 
 
 		 566 aa  43.1  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  29.27 
 
 		 783 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  29.27 
 
 		 783 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  29.27 
 
 		 783 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>