40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2516 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  100 
 
 		 445 aa  915    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  90.68 
 
 		 458 aa  830    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 698 aa  240  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  29.3 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  29.3 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  30.58 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  30.42 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  29.33 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  27.96 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  23.53 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  25.55 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  20.47 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  25.74 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  33.33 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  23.87 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.76 
 
 		 868 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  33.33 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  24.43 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  30.25 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1704  putative neutral invertase-like protein  19.1 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04191  putative neutral invertase-like protein  19.1 
 
 		 483 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  25.32 
 
 		 610 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  22.1 
 
 		 485 aa  46.6  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2298  hypothetical protein  25.24 
 
 		 827 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.16 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.35 
 
 		 781 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  28.35 
 
 		 834 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.4 
 
 		 732 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  26.43 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  26.43 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  26.43 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  30 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  23.33 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  28.37 
 
 		 651 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03631  putative neutral invertase-like protein  20.78 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.45 
 
 		 685 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  30.17 
 
 		 674 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  23.63 
 
 		 660 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21831  putative neutral invertase-like protein  27.04 
 
 		 488 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  25.71 
 
 		 446 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>