21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0397 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  100 
 
 
463 aa  941    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  45.28 
 
 
485 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1704  putative neutral invertase-like protein  45.45 
 
 
483 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03591  putative neutral invertase-like protein  43.67 
 
 
479 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.628204  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04191  putative neutral invertase-like protein  45.68 
 
 
483 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03511  putative neutral invertase-like protein  43.38 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268956  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03531  putative neutral invertase-like protein  43.8 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03631  putative neutral invertase-like protein  44.85 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072592  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0333  putative neutral invertase-like protein  43.16 
 
 
479 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21831  putative neutral invertase-like protein  44.65 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  45.23 
 
 
485 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  39.61 
 
 
465 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  39.66 
 
 
474 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  39.19 
 
 
492 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  36.89 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  38.46 
 
 
483 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  36.28 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  25.55 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  23.71 
 
 
698 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  24.51 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  21.15 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>