57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4480 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  33.82 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  32.45 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  29.69 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 581 aa  132  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  29.69 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  29.14 
 
 		 478 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  28.64 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  26.84 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  27.04 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  30.02 
 
 		 543 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  27.89 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  22.78 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  24.19 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  26.44 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  22.44 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  25.25 
 
 		 732 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  26.23 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  25.75 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 721 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  27.9 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  22.88 
 
 		 708 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  22.46 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  24.39 
 
 		 790 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.68 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 718 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  23.61 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  22.78 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  26.58 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  25.23 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  24.44 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  24.44 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  24.44 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  24.32 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  20.05 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  23.87 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  23.35 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  24.92 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  23.58 
 
 		 681 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.33 
 
 		 566 aa  53.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  25.77 
 
 		 783 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  25.77 
 
 		 783 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  31.73 
 
 		 783 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  25.15 
 
 		 783 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  31.73 
 
 		 783 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  31.73 
 
 		 783 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  31.73 
 
 		 783 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  31.73 
 
 		 783 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  23.17 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  25.25 
 
 		 921 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  25.83 
 
 		 881 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  25.69 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  22.93 
 
 		 509 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  27.36 
 
 		 896 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  22.4 
 
 		 887 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  25.43 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>