38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0383 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  100 
 
 
474 aa  971    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  50.63 
 
 
477 aa  498  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.98 
 
 
681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  25.11 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.5 
 
 
717 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
581 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  21.86 
 
 
738 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  22.46 
 
 
444 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  21.72 
 
 
732 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  21.25 
 
 
718 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  24.51 
 
 
515 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  20.83 
 
 
721 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  24.07 
 
 
914 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.71 
 
 
852 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  19.92 
 
 
745 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  25.49 
 
 
516 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  26.34 
 
 
790 aa  53.9  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  21.57 
 
 
522 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  21.37 
 
 
708 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  20.59 
 
 
565 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  20.59 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  20.59 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.414079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  20.59 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  20.59 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  20.59 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  23.13 
 
 
896 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  31.37 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  20.59 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  22.16 
 
 
570 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  20.96 
 
 
568 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  22.16 
 
 
569 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  25.68 
 
 
432 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  24.48 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  22.54 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  24.1 
 
 
815 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  22.86 
 
 
890 aa  44.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  19.71 
 
 
524 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.19 
 
 
759 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>