30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0996 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  988    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  50.63 
 
 		 474 aa  498  1e-140  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  27.72 
 
 		 681 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  27.47 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.19 
 
 		 732 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  22.65 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.09 
 
 		 717 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  22.76 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.69 
 
 		 852 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  31.76 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 738 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  25.37 
 
 		 516 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.68 
 
 		 781 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  26.11 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  22.97 
 
 		 723 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  20.62 
 
 		 708 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  24.2 
 
 		 815 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  21.08 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  21.21 
 
 		 718 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  21.91 
 
 		 706 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  22.22 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  24.86 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  30.1 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  22.41 
 
 		 565 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  36.54 
 
 		 811 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.05 
 
 		 740 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.05 
 
 		 740 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  20.63 
 
 		 729 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>