37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1131 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 		 914 aa  1899    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.07 
 
 		 732 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  32.17 
 
 		 445 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  29.23 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.41 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  21.47 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  20.98 
 
 		 708 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.39 
 
 		 566 aa  57  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  24.07 
 
 		 474 aa  56.2  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  20.89 
 
 		 833 aa  54.3  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  21.48 
 
 		 718 aa  53.5  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  24.24 
 
 		 444 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  25.84 
 
 		 745 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  19.68 
 
 		 738 aa  50.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  22.16 
 
 		 681 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.63 
 
 		 751 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  26.04 
 
 		 727 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  22.37 
 
 		 510 aa  49.7  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  20.21 
 
 		 570 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  28.76 
 
 		 459 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  21.87 
 
 		 509 aa  47.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.95 
 
 		 726 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  20.21 
 
 		 569 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  27.64 
 
 		 423 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  20.21 
 
 		 565 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  21.2 
 
 		 896 aa  46.2  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  23.15 
 
 		 783 aa  45.8  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  27.17 
 
 		 621 aa  45.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  20.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.68 
 
 		 760 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  19.95 
 
 		 570 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  20.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  20.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  20.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  20.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  20.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>