34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000897 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  47.56 
 
 		 783 aa  783    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  100 
 
 		 896 aa  1870    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  47.39 
 
 		 783 aa  780    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  47.22 
 
 		 783 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  47.56 
 
 		 783 aa  784    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  47.45 
 
 		 783 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  48.33 
 
 		 790 aa  791    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  47.62 
 
 		 783 aa  782    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  47.45 
 
 		 783 aa  781    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  48.76 
 
 		 896 aa  831    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  47.39 
 
 		 783 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  37.79 
 
 		 852 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  35.31 
 
 		 732 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  32.84 
 
 		 708 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 738 aa  265  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 718 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 721 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  32.97 
 
 		 717 aa  243  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 581 aa  97.8  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  28.87 
 
 		 745 aa  75.1  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  26.47 
 
 		 476 aa  62  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  23.71 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  22.92 
 
 		 452 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  25.44 
 
 		 423 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.81 
 
 		 543 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  28.23 
 
 		 459 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  28.46 
 
 		 441 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  26.32 
 
 		 478 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  25.22 
 
 		 566 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  22.9 
 
 		 433 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.2 
 
 		 914 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  33.78 
 
 		 431 aa  45.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  27.36 
 
 		 444 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  23.77 
 
 		 445 aa  44.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>