45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3374 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  99.11 
 
 		 783 aa  1617    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  47.56 
 
 		 896 aa  784    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  98.85 
 
 		 783 aa  1615    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  97.57 
 
 		 783 aa  1599    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 783 aa  1629    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  98.98 
 
 		 783 aa  1616    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  73.42 
 
 		 790 aa  1223    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  98.47 
 
 		 783 aa  1610    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  98.98 
 
 		 783 aa  1616    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  45.73 
 
 		 896 aa  754    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  98.85 
 
 		 783 aa  1615    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  37.68 
 
 		 852 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  35.95 
 
 		 732 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  36.93 
 
 		 717 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 		 718 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 738 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 		 721 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  34.29 
 
 		 708 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 		 581 aa  106  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  24.85 
 
 		 444 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  23.42 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  30.21 
 
 		 745 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  29.01 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  23.23 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  32.17 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  28.12 
 
 		 478 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  30.56 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  27.75 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  24.59 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.75 
 
 		 566 aa  55.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  23.43 
 
 		 509 aa  53.9  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  30.53 
 
 		 459 aa  52  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  31.73 
 
 		 444 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  25.64 
 
 		 423 aa  51.6  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.54 
 
 		 759 aa  51.6  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  27.27 
 
 		 456 aa  50.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  22.68 
 
 		 431 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  19.41 
 
 		 433 aa  50.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  27.87 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  26.92 
 
 		 468 aa  45.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.91 
 
 		 725 aa  45.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.95 
 
 		 765 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.29 
 
 		 757 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  24.29 
 
 		 757 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.44 
 
 		 720 aa  44.3  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>