41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06895 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  45.62 
 
 		 783 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  48.76 
 
 		 896 aa  831    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  45.39 
 
 		 783 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  44.79 
 
 		 783 aa  747    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  45.73 
 
 		 783 aa  754    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  45.5 
 
 		 783 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  45.39 
 
 		 783 aa  751    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  46.44 
 
 		 790 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  45.06 
 
 		 783 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  45.62 
 
 		 783 aa  755    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 896 aa  1862    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  31.01 
 
 		 852 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  34.65 
 
 		 732 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  32.28 
 
 		 708 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 721 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  30.88 
 
 		 717 aa  209  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 718 aa  208  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 738 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 581 aa  105  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  32.22 
 
 		 745 aa  89.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  28.88 
 
 		 452 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  29.38 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  27.1 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  26.04 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  25.86 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  24.7 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  22.8 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.64 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  21.13 
 
 		 433 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  27.49 
 
 		 723 aa  52.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  25.79 
 
 		 445 aa  52  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.91 
 
 		 734 aa  50.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  24.14 
 
 		 681 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  23.13 
 
 		 474 aa  49.7  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  26 
 
 		 734 aa  48.5  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.27 
 
 		 723 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  24.64 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  23.78 
 
 		 509 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  22.16 
 
 		 510 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  37.1 
 
 		 894 aa  45.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.18 
 
 		 736 aa  44.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>