55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0716 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1161    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  31.43 
 
 
575 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.54 
 
 
543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
738 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.49 
 
 
732 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.17 
 
 
717 aa  97.4  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  24.61 
 
 
708 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  24.43 
 
 
852 aa  93.6  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.35 
 
 
718 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  22.09 
 
 
581 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  23.35 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  20 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  24.91 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  21.32 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  21.85 
 
 
468 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  28.4 
 
 
422 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  22.1 
 
 
408 aa  64.7  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  19.8 
 
 
433 aa  64.3  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  25.7 
 
 
423 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  22.22 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  26.77 
 
 
444 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  26.52 
 
 
456 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  22.86 
 
 
790 aa  57.4  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.39 
 
 
914 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  24.6 
 
 
514 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  25.48 
 
 
749 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  24.6 
 
 
514 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  23.22 
 
 
783 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  22.75 
 
 
783 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  22.75 
 
 
783 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  22.75 
 
 
783 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  22.75 
 
 
783 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  22.75 
 
 
783 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  22.75 
 
 
783 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  22.75 
 
 
783 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  22.8 
 
 
452 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  19.54 
 
 
431 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  24.09 
 
 
833 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  30.08 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  35.29 
 
 
424 aa  51.2  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  25.22 
 
 
896 aa  50.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  23.98 
 
 
440 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  21.85 
 
 
681 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  20.39 
 
 
912 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.6 
 
 
444 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  21.95 
 
 
476 aa  47.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  21.59 
 
 
745 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  24.64 
 
 
896 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  28 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  21.27 
 
 
917 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  26.78 
 
 
910 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  24.26 
 
 
901 aa  43.5  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  26.97 
 
 
446 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>