79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1369 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  51.63 
 
 		 660 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 659 aa  1361    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  75.11 
 
 		 659 aa  1046    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  45.58 
 
 		 668 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  44.66 
 
 		 659 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  43.37 
 
 		 663 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  44.66 
 
 		 655 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  39.3 
 
 		 663 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  43.04 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  39.94 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  38.86 
 
 		 661 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  38.04 
 
 		 672 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  38.89 
 
 		 674 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  40.89 
 
 		 662 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  37.74 
 
 		 672 aa  432  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  38.6 
 
 		 678 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  38.28 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  38.28 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  38.43 
 
 		 678 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  36.16 
 
 		 651 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  39.08 
 
 		 675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  35.57 
 
 		 681 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  36.56 
 
 		 652 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  35.15 
 
 		 712 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  36.79 
 
 		 672 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  38.03 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  38.54 
 
 		 693 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  36.79 
 
 		 657 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  38.3 
 
 		 693 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  38.03 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.04 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  35.17 
 
 		 687 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.56 
 
 		 720 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.85 
 
 		 662 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  34.5 
 
 		 660 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  35.39 
 
 		 614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  34.79 
 
 		 611 aa  326  8.000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.35 
 
 		 659 aa  323  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.77 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.34 
 
 		 651 aa  292  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  31.42 
 
 		 658 aa  283  8.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.09 
 
 		 565 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.28 
 
 		 1433 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.6 
 
 		 1526 aa  96.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  24.94 
 
 		 1537 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  23.45 
 
 		 1593 aa  84  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.32 
 
 		 720 aa  73.9  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.38 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.65 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.03 
 
 		 623 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.92 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.81 
 
 		 735 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.72 
 
 		 868 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.27 
 
 		 764 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  23.7 
 
 		 758 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.38 
 
 		 721 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.13 
 
 		 698 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.39 
 
 		 734 aa  54.3  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.07 
 
 		 781 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.81 
 
 		 765 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.37 
 
 		 682 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.13 
 
 		 732 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.94 
 
 		 612 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.23 
 
 		 741 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.94 
 
 		 778 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.78 
 
 		 778 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.3 
 
 		 751 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.78 
 
 		 778 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.74 
 
 		 759 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  23.5 
 
 		 757 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.49 
 
 		 723 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  24.02 
 
 		 727 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.69 
 
 		 708 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.76 
 
 		 757 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.28 
 
 		 760 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.72 
 
 		 729 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.29 
 
 		 722 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.69 
 
 		 746 aa  44.3  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.57 
 
 		 718 aa  44.3  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>