67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3855 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  60.88 
 
 		 675 aa  751    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  97.69 
 
 		 693 aa  1261    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  57.81 
 
 		 678 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  57.97 
 
 		 678 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 693 aa  1358    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  94.24 
 
 		 692 aa  1220    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  41.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  38.1 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  42.6 
 
 		 674 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.35 
 
 		 663 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  39.58 
 
 		 659 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  42.51 
 
 		 655 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  39.76 
 
 		 662 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  35.95 
 
 		 712 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  37.14 
 
 		 663 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  37.95 
 
 		 657 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  37.8 
 
 		 657 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  42.06 
 
 		 668 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  41.27 
 
 		 681 aa  415  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  41.27 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  33.69 
 
 		 672 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  38.2 
 
 		 659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  38.43 
 
 		 659 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  33.33 
 
 		 672 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  36.98 
 
 		 660 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  39.88 
 
 		 672 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  38.96 
 
 		 610 aa  365  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  33.13 
 
 		 651 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  36.44 
 
 		 652 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.48 
 
 		 659 aa  337  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  35.71 
 
 		 687 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  35.23 
 
 		 686 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  37.68 
 
 		 720 aa  333  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.16 
 
 		 662 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.4 
 
 		 660 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.08 
 
 		 641 aa  303  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  29.45 
 
 		 614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  31.27 
 
 		 611 aa  270  8e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.47 
 
 		 651 aa  246  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30.36 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.64 
 
 		 565 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.22 
 
 		 656 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.16 
 
 		 1433 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.85 
 
 		 1537 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.4 
 
 		 1526 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  21.79 
 
 		 1593 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.41 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.08 
 
 		 721 aa  60.8  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.1 
 
 		 718 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.89 
 
 		 741 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.85 
 
 		 746 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.52 
 
 		 719 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.05 
 
 		 720 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.5 
 
 		 708 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  24.94 
 
 		 737 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.88 
 
 		 751 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.4 
 
 		 623 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  26.81 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  24.22 
 
 		 727 aa  48.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.06 
 
 		 725 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  25.13 
 
 		 706 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.99 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  26.7 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.2 
 
 		 700 aa  45.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  26.71 
 
 		 729 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  26.21 
 
 		 715 aa  44.3  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.43 
 
 		 741 aa  43.9  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>