66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2331 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  100 
 
 		 672 aa  1378    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  95.54 
 
 		 672 aa  1321    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  47.72 
 
 		 659 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  45.3 
 
 		 663 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  44.48 
 
 		 651 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  40.27 
 
 		 668 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.59 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  39.97 
 
 		 659 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  40.96 
 
 		 660 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  40.15 
 
 		 661 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  37.84 
 
 		 655 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  38.19 
 
 		 659 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  35.93 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  37.95 
 
 		 661 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  37.8 
 
 		 657 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  38.15 
 
 		 657 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  36.23 
 
 		 678 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  36.66 
 
 		 678 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  35.23 
 
 		 681 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  37.44 
 
 		 662 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  37.02 
 
 		 610 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  35.48 
 
 		 675 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  33.19 
 
 		 693 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  34.55 
 
 		 652 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  32.74 
 
 		 693 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  32.74 
 
 		 692 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  34.07 
 
 		 657 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  33.43 
 
 		 672 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  33.08 
 
 		 720 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  32.37 
 
 		 686 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  31.8 
 
 		 641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  43.48 
 
 		 712 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.16 
 
 		 662 aa  323  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  31.41 
 
 		 660 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  31.14 
 
 		 687 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.61 
 
 		 656 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.31 
 
 		 659 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  29.86 
 
 		 611 aa  270  8e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  31.6 
 
 		 614 aa  266  7e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  28.23 
 
 		 658 aa  243  7.999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.21 
 
 		 651 aa  242  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.7 
 
 		 565 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.18 
 
 		 1433 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  25.81 
 
 		 1593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  25.65 
 
 		 1526 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.16 
 
 		 1537 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  21.8 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.84 
 
 		 725 aa  78.2  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.21 
 
 		 720 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.74 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  21.53 
 
 		 758 aa  60.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.07 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.39 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.89 
 
 		 723 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.92 
 
 		 654 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.91 
 
 		 685 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.24 
 
 		 746 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.22 
 
 		 868 aa  50.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.19 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  22.77 
 
 		 645 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  21.38 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.22 
 
 		 708 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.4 
 
 		 733 aa  45.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  23.27 
 
 		 476 aa  45.8  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  23.81 
 
 		 959 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.12 
 
 		 723 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>