55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3944 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  59 
 
 		 668 aa  802    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  53.48 
 
 		 659 aa  698    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  48.86 
 
 		 663 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 663 aa  1377    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  55.69 
 
 		 655 aa  729    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  47 
 
 		 661 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  44.95 
 
 		 659 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  43.71 
 
 		 660 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  43.37 
 
 		 659 aa  528  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  43.42 
 
 		 674 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  41.74 
 
 		 672 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  43.32 
 
 		 681 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  41.29 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  44.07 
 
 		 662 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  42.22 
 
 		 657 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  42.22 
 
 		 657 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  40.43 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  39.8 
 
 		 712 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  41.62 
 
 		 652 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  41.53 
 
 		 657 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  41.33 
 
 		 610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  39.06 
 
 		 678 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  38.76 
 
 		 678 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  40.36 
 
 		 672 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  40.99 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  38.08 
 
 		 686 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  40.9 
 
 		 693 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  41.03 
 
 		 693 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  39.49 
 
 		 675 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  35.64 
 
 		 651 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  36.39 
 
 		 687 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  35.86 
 
 		 641 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  36.6 
 
 		 720 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.09 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.49 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.7 
 
 		 659 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  33.59 
 
 		 611 aa  306  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  33.54 
 
 		 614 aa  296  9e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.56 
 
 		 651 aa  289  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.75 
 
 		 656 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30.5 
 
 		 658 aa  283  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.96 
 
 		 565 aa  243  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.52 
 
 		 1433 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  26.11 
 
 		 1526 aa  96.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  24.89 
 
 		 1593 aa  96.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  24.89 
 
 		 1537 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.62 
 
 		 720 aa  60.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.68 
 
 		 658 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.03 
 
 		 746 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.84 
 
 		 708 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.14 
 
 		 698 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.28 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21 
 
 		 685 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.4 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0439  electron transfer flavoprotein alpha subunit  24.6 
 
 		 302 aa  44.3  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>