73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0471 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 720 aa  1476    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  37.58 
 
 		 660 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  37.52 
 
 		 659 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  38.74 
 
 		 655 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  36.32 
 
 		 661 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  36.11 
 
 		 659 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  36.6 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.48 
 
 		 641 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  37.58 
 
 		 668 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  37.01 
 
 		 652 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  35.56 
 
 		 659 aa  366  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  35.1 
 
 		 663 aa  364  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.78 
 
 		 662 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  34.18 
 
 		 661 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  33.98 
 
 		 712 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  35.91 
 
 		 610 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  36.76 
 
 		 662 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  35.63 
 
 		 674 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.6 
 
 		 660 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  32.67 
 
 		 672 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  33.08 
 
 		 672 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  33.79 
 
 		 658 aa  335  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.01 
 
 		 651 aa  332  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  34.22 
 
 		 657 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  35.2 
 
 		 681 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  33.44 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  34.07 
 
 		 657 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  36.62 
 
 		 678 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  36.65 
 
 		 678 aa  320  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  38.12 
 
 		 693 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  37.81 
 
 		 692 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  37.39 
 
 		 693 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  36.58 
 
 		 675 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  33.62 
 
 		 686 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  35.13 
 
 		 657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  34.02 
 
 		 672 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  32.52 
 
 		 614 aa  298  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  33.52 
 
 		 687 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.14 
 
 		 659 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.19 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  35.49 
 
 		 651 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.52 
 
 		 565 aa  220  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.63 
 
 		 1433 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  22.99 
 
 		 1593 aa  89  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.04 
 
 		 1526 aa  81.3  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  24.06 
 
 		 1537 aa  78.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  23.44 
 
 		 737 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.83 
 
 		 726 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.05 
 
 		 718 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  25.66 
 
 		 706 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.07 
 
 		 725 aa  48.5  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.88 
 
 		 685 aa  47.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.38 
 
 		 765 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.26 
 
 		 700 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.36 
 
 		 722 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.68 
 
 		 723 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.56 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  22.93 
 
 		 715 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  27.59 
 
 		 712 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.88 
 
 		 708 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.88 
 
 		 734 aa  45.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.82 
 
 		 734 aa  45.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  26.93 
 
 		 675 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  27.18 
 
 		 770 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.26 
 
 		 764 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.58 
 
 		 685 aa  44.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.18 
 
 		 797 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.93 
 
 		 770 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.18 
 
 		 776 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.18 
 
 		 776 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.08 
 
 		 751 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.06 
 
 		 721 aa  43.9  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.26 
 
 		 719 aa  43.9  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>